Ковальский Д. Б. Обобщенный параметр упорядочения <$E bold roman S sup 2> для связи N-H пептидной группы как мера конформационной подвижности белка: сравнение алгоритмов расчета <$E bold roman S sup 2> из данных симуляции молекулярной динамики / Д. Б. Ковальский, О. С. Иванова, В. Н. Дубина, Д. С. Каниболоцкий, А. И. Корнелюк // Укр. біохім. журн.. - 2004. - 76, № 2. - С. 128-132. - Библиогр.: 13 назв. - рус.Зазначено, що метод молекулярної динаміки в поєднанні з методом ЯМР є потужним засобом для дослідження конформаційного стану біополімерів у розчині. Порівняно два алгоритми розрахунку узагальненого параметра упорядкування з результатів розрахунку молекулярної динаміки. Вивчено вплив параметрів алгоритму на результат розрахунку. Проведено симуляцію молекулярної динаміки ВІЛ-1-протеази в водному середовищі за допомогою пакета програм GROMACS 3,1,4 протягом 7,36 нс. Розраховані значення параметра упорядкування добре узгоджуються з літературними даними, одержаними за допомогою методу ЯМР. Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.3в641
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) ![](/irbis_nbuv/images/info.png) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|