Разработан новый алгоритм расчета параметра упорядочения связи N - H пептидных групп белков, исходя из траекторий движения их атомов, полученных с помощью метода молекулярной динамики. Для верификации алгоритма смоделированы коллективные движения атомов ВИЧ-1-протеазы (3.4.23.16) с монопротонированным активным центром в воде при рН 3,5 - 6,5. Показано, что ферменту присущ набор конформаций, промежуточных между "открытой" и "закрытой" формами. Рассчитанные на основании предложенного алгоритма значения параметра упорядочения связей N - H пептидных групп удовлетворительно согласуются с экспериментальными данными, полученными с помощью метода ядерного магнитного резонанса.

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"