РЕФЕРАТИВНА БАЗА ДАНИХ "УКРАЇНІКА НАУКОВА"
Abstract database «Ukrainica Scientific»


Бази даних


Реферативна база даних - результати пошуку


Вид пошуку
Пошуковий запит: (<.>ID=REF-0000583472<.>)
Загальна кількість знайдених документів : 1

Bondarenko V. S. 
Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus = Біоінформатичний аналіз цис-регуляторних елементів в генах Mbl1 і Mbl2 Rattus norvegicus / V. S. Bondarenko, M. Yu. Obolenska // Biopolymers and Cell. - 2015. - 31, № 1. - С. 63-71. - Бібліогр.: 54 назв. - англ.

Мета роботи - провести біоінформатичне дослідження промоторів генів Mbl1 і Mbl2 Rattus norvegicus, що кодують манозозв'язуючі лектини, на наявність та функціональну специфічність сайтів зв'язування транскрипційних факторів. Обидві послідовності промоторів довжиною 1100 п.н. проаналізовано в програмі MatInspector за використання позиційно-вагових матриць з бази данних Matrix Family Library Version 9.0. В межах програми відібрано сайти зв'язування для транскрипційних факторів, які специфічно експресуються в печінці та клітинах імунної системи, а також, що пройшли тест щодо консервативності шляхом порівняння з сайтами зв'язування транскрипційних факторів у промоторах генів - ортологів Mus musculus. В промоторах гена Mbl1 і гена Mbl2 наявні сайти для 4-х родин транскрипційних факторів (HNF, homeodomain transcription factors, GRs and ETS factors). В промоторі гена Mbl1 виявлено також сайти для представників 6-х (AP1 related factors, Ccaat/Enhancer Binding Proteins, FOX, p53, NFAT, ISGF3), a в гені Mbl2 - для 4-х (cAMP-responsive element binding proteins, heat shock factors, Nf-кВ/с-rel and TATA binding protein) інших родин транскрипційних факторів. Характерні для гена Mbl1 транскрипційні фактори переважно задіяні в регуляції диференціювання, розвитку, підтримання гомеостаз), клітинного циклу. Через характерні для гена Mbl2 сайти транскрипційні фактори можуть опосередковувати переважно відповідь на чинники, які індукують стрес. Висновки: різноманітність транскрипційних факторів, які потенційно можуть регулювати транскрипцію обох генів, вказує на можливу участь генів в різних клітинних процесах зі специфічною функцією кожного з генів. Одержані результати є підставою для цілеспрямованого експериментального дослідження регуляції транскрипції зазначених генів.


Індекс рубрикатора НБУВ: Е623.362.423*440.16

Рубрики:

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 
Повний текст  Наукова періодика України 
  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
 
Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського
Відділ наукового формування національних реферативних ресурсів
Інститут проблем реєстрації інформації НАН України

Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського