Вивчено біологічну різноманітність і біологічні характеристики аеробних споротвірних бактерій глибоководних донних відкладень Чорного моря, визначено їх потенціал щодо продукції антимікробних сполук. В результаті досліджень у глибоководних осадах Чорного моря з екстремальними анаеробними умовами відкрито аеробні споротвірні бактерії, охарактеризовано їх біологічну різноманітність, а також біологічні властивості, структуру геномів, метаболомів і спектри антимікробних сполук антагоністично активних штамів. Уперше з донних відкладень Чорного моря виділено ізоляти споротвірних бактерій, які методом аналізу профілів жирних кислот віднесено до 14-ох видів та охарактеризовано за антагоністичною активністю по відношенню до опортуністичних патогенів людини і тварин. За результатами скринінгу відібрано 3 штами, ідентифіковані методами молекулярної філогенетики та порівняльної геноміки як В. velezensis ONU 553, В. pumilus ONU 554 та В. subtilis ONU 559, з найбільш високим рівнем антагоністичної активності. Розраховані індекси термофільності й аналіз амінокислотних спектрів за методом Moura вказують на неаборигенність їх до біотопів донних відкладень з екстремальними анаеробними умовами та низькими температурами. Показано, що склад вуглеводів, спектри утилізації цукрів, чутливість до антибіотиків, морфологія клітин і послідовності гена 16S РНК є типовими для цих видів. Із використанням біоінформатичних інструментів уперше ідентифіковано біосинтетичні кластери ліпопептидів групи сурфактинів підгрупи пумілацидинів і гагеотетрину із групи сурфактинів, амікумацинового антибіотика АІ-77, зроблено припущення про виявлення біосинтетичного кластера пентапептиду GPFPI. Зазначено, що дані про інші сполуки, ідентифіковані для бацил вперше, потребують подальшої верифікації. Одержані дані поповнюють знання про біосинтетичний потенціал морських бацил. Методом рідинної хромато-масспектрометрії у бактерій штаму В. velezensis ONU 553 виявлено й ідентифіковано 90, В. pumilus ONU 554 - 33, В. subtilis ONU 559 - 43 метаболіти. Знайдені в екзометаболомі сполуки поділено на дві групи: такі, що вже відомі для представників роду Bacillus, та нові, як для цього роду, так і для прокаріот взагалі. Серед вторинних метаболітів досліджуваних штамів виявлено варіанти найбільш вивченого класу нерибосомних пептидів - сурфактинів (антеізо-C16-сурфактин, сурфактин B2 I-Me естер), гагеостатинів, фенгіцинів та амікумацинів, а також секретований пентапептид зі здатністю до інгібування протеаз GPFPI. Дані про інші сполуки, ідентифіковані для бацил вперше, потребують подальшої верифікації. Поповнено Колекцію морських бактерій Одеського національного університету імені І. І. Мечникова новими штамами. Зазначено, що одержані дані щодо геномів та екзометаболомів досліджених штамів можуть слугувати науковою основою для розробки на їх основі продуцентів нових для промисловості сполук і пробіотичних препаратів.

 Автореферати дисертацій 

---

Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
(cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)

• Штеніков Микола Дмитрович (біологічні науки)

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"